{"id":1632,"date":"2017-11-25T19:57:41","date_gmt":"2017-11-25T17:57:41","guid":{"rendered":"http:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/?page_id=1632"},"modified":"2017-11-25T19:57:41","modified_gmt":"2017-11-25T17:57:41","slug":"intro-emboss","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/alu.ugr.es\/bioinfo\/biocomputacion\/intro-emboss\/","title":{"rendered":"Intro EMBOSS"},"content":{"rendered":"<p>A partir de una secuencia de ADN se pueden calcular una seria de propiedades composicionales que nos pueden facilitar informaci\u00f3n valida acerca de la secuencia y su organismo portador. El contenido en G+C de una secuencia es simplemente la fracci\u00f3n de guaninas y citosinas sobre el total de las 4 bases (en ausencia de bases ambiguas, este n\u00famero es id\u00e9ntico a la longitud de la secuencia). Su an\u00e1lisis a lo largo de la secuencia nos puede dar una idea donde se localizan promotores y exones, regiones que se suelen caracterizar por destacar en su contenido en G+C sobre su entorno.<\/p>\n<p>Sin embargo, a\u00fan m\u00e1s informativo es la frecuencia de los dinucle\u00f3tidos. En mam\u00edferos existen metiltransferasas que metilan las citosinas en un contexto CpG. Una citosina metilada desamina espont\u00e1neamente hacia timina, y no hacia uracilo como una citosina nometilada. Por ello, la metilaci\u00f3n es el principal causante de mutaciones puntuales y cerca de dos tercios de todos los SNPs en la poblaci\u00f3n humana se encuentran en el contexto CpG. La metilaci\u00f3n de citosinas por lo tanto causa la perdida evolutiva de dinucle\u00f3tidos CpG y en una secuencia t\u00edpica de un mam\u00edfero se detectan solamente la quinta parte de los CpGs esperados. Por lo tanto, solamente mediante un an\u00e1lisis de las frecuencias de dinucle\u00f3tidos podemos determinar si la secuencia an\u00f3nima proviene de un mam\u00edfero o no.<\/p>\n<p id=\"BrvwzvI\">\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>A partir de una secuencia de ADN se pueden calcular una seria de propiedades composicionales que nos pueden facilitar informaci\u00f3n valida acerca de la secuencia y su organismo portador. El contenido en G+C de una secuencia es simplemente la fracci\u00f3n <a href=\"https:\/\/alu.ugr.es\/bioinfo\/biocomputacion\/intro-emboss\/\" class=\"read-more\">Read More &#8230;<\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"parent":0,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":{"footnotes":""},"class_list":["post-1632","page","type-page","status-publish","hentry"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/alu.ugr.es\/bioinfo\/biocomputacion\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/1632","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/alu.ugr.es\/bioinfo\/biocomputacion\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/alu.ugr.es\/bioinfo\/biocomputacion\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/alu.ugr.es\/bioinfo\/biocomputacion\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/alu.ugr.es\/bioinfo\/biocomputacion\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=1632"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/alu.ugr.es\/bioinfo\/biocomputacion\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/1632\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/alu.ugr.es\/bioinfo\/biocomputacion\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=1632"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}