{"id":234,"date":"2013-05-31T23:28:35","date_gmt":"2013-05-31T21:28:35","guid":{"rendered":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/?page_id=234"},"modified":"2013-05-31T23:28:35","modified_gmt":"2013-05-31T21:28:35","slug":"analisis-composicional","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/alu.ugr.es\/bioinfo\/?page_id=234","title":{"rendered":"An\u00e1lisis composicional"},"content":{"rendered":"<p>Ya hemos visto en el tema anterior como se determina la longitud y el contenido global en G+C (%GC) de una secuencia (<a href=\"http:\/\/emboss.bioinformatics.nl\/cgi-bin\/emboss\/infoseq\" target=\"_blank\"><b><i>infoseq<\/i><\/b><\/a>).<\/p>\n<p>Tambi\u00e9n es interesante determinar la variaci\u00f3n espacial del %GC a lo largo de una secuencia (<a href=\"http:\/\/emboss.bioinformatics.nl\/cgi-bin\/emboss\/freak\" target=\"_blank\"><b><i>freak<\/i><\/b><\/a>).<\/p>\n<p>La composici\u00f3n de una secuencia de ADN se puede estudiar determinando las frecuencias de mononucle\u00f3tidos, dinucle\u00f3tidos, etc<\/p>\n<p>Para ello se usa una ventana movil que se va desplazando posici\u00f3n a posici\u00f3n a lo largo de la secuencia (<a href=\"http:\/\/emboss.bioinformatics.nl\/cgi-bin\/emboss\/compseq\" target=\"_blank\"><b><i>compseq<\/i><\/b><\/a>). Por ejemplo, para determinar la frecuencia de dinucle\u00f3tidos se usa una ventana de tama\u00f1o 2 y salto de 1:<\/p>\n<p>ATTCCGTGAACTG&#8230;<\/p>\n<p>AT, TT, TC, CG, GT&#8230;<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Ya hemos visto en el tema anterior como se determina la longitud y el contenido global en G+C (%GC) de una secuencia (infoseq). Tambi\u00e9n es interesante determinar la variaci\u00f3n espacial del %GC a lo largo de una secuencia (freak). La composici\u00f3n de una secuencia de ADN se puede estudiar determinando las frecuencias de mononucle\u00f3tidos, dinucle\u00f3tidos, [&hellip;]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"parent":1997,"menu_order":2,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":{"footnotes":""},"class_list":["post-234","page","type-page","status-publish","hentry"],"blocksy_meta":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/alu.ugr.es\/bioinfo\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages\/234","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/alu.ugr.es\/bioinfo\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/alu.ugr.es\/bioinfo\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/alu.ugr.es\/bioinfo\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/alu.ugr.es\/bioinfo\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=234"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/alu.ugr.es\/bioinfo\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages\/234\/revisions"}],"up":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/alu.ugr.es\/bioinfo\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages\/1997"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/alu.ugr.es\/bioinfo\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=234"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}