{"id":66,"date":"2013-05-29T21:09:52","date_gmt":"2013-05-29T19:09:52","guid":{"rendered":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/?page_id=66"},"modified":"2013-05-29T21:09:52","modified_gmt":"2013-05-29T19:09:52","slug":"ejercicios1","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/alu.ugr.es\/bioinfo\/?page_id=66","title":{"rendered":"Ejercicios"},"content":{"rendered":"
\n

Ejercicio 1<\/h4>\n
    \n
  1. Busque \u2018hiv2ben\u2019 en el NCBI<\/a><\/li>\n
  2. Ver\u00e1 que aparecen 2 registros en el apartado \u2018Nucleotide sequences\u2019<\/li>\n
  3. Pinche sobre \u20192\u2032 y luego sobre \u2018Human immunodeficiency virus type 2, complete proviral genome\u2019. Se obtiene la entrada del HIV en formato GenBank.<\/li>\n
  4. Examine los primeros apartados de la anotaci\u00f3n: LOCUS, DEFINITION, ACCESSION\u2026 y sus distintos campos. Anote el n\u00famero de registro asignado a esta secuencia: U38293<\/li>\n
  5. Analice en detalle la tabla de FEATURES: gene, CDS, translation\u2026<\/li>\n
  6. Busque la linea ORIGIN y preste atenci\u00f3n a la manera en que se lista la secuencia de nucle\u00f3tidos<\/li>\n
  7. Guarde en disco una copia de la entrada (Send \u2013> Complete record \u2013> File \u2013> Format GenBank \u2013> Create File) y elija una carpeta para guardarla. Despu\u00e9s enviese el archivo a su buz\u00f3n de correo.<\/li>\n<\/ol>\n

    Ejercicio 2<\/h4>\n
      \n
    1. Vuelva al principio de la entrada anterior y pinche en \u2018FASTA\u2019.<\/li>\n
    2. N\u00f3tese el formato compacto para la secuencia y la \u00fanica linea de anotaci\u00f3n comenzando por el s\u00edmbolo \u2018>\u2019<\/li>\n<\/ol>\n

      Ejercicio 3<\/h4>\n
        \n
      1. Pinche ahora en \u2018Graphics\u2019 y explore la secuencia con ayuda del navegador gr\u00e1fico<\/li>\n
      2. Haga zoom hasta el nivel de secuencia mediante el boton \u2018ATG\u2019 y examine los codones de inicio y de stop de cada gen<\/li>\n
      3. Utilice el bot\u00f3n \u2018Link to this page\u2019 para obtener un enlace a esa p\u00e1gina (Tiny URL) y enviarlo a su buz\u00f3n de correo<\/li>\n<\/ol>\n

        Ejercicio 4<\/h4>\n
          \n
        1. Usando el numero de registro U38293, busque ahora esta secuencia en la base de datos de nucle\u00f3tidos del EMBL<\/a><\/li>\n
        2. Pinche en el enlace correspondiente en el apartado \u2018Nucleotide sequences\u2019 y examine la entrada en formato EMBL. Note las diferencias con el formato GenBank<\/li>\n
        3. Examine la entrada con el navegador integrado<\/li>\n
        4. En el panel \u2018Overview\u2019 cambie las coordenadas para examinar distintas partes de la secuencia<\/li>\n
        5. Pinchando con el bot\u00f3n derecho sobre el panel \u2018Overview\u2019, guarde una imagen de una regi\u00f3n de la secuencia y enviela a su buzon de correo<\/li>\n<\/ol>\n<\/div>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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